Bioinformatiker med molekylær virologisk baggrund til tidsbegrænset 2-årig stilling

Er du skarp til virologisk qPCR assay design?

Kunne du tænke dig at arbejde med kvalitetssikring?

Synes du vedligehold af et Python-baseret workflow lyder som en spændende udfordring?

Jobbets indhold
Stillingen er tilknyttet Sektion for Virus Beredskab ved Afdeling for Virologi og Mikrobiologisk Beredskab. Arbejdsopgaverne omfatter ansvar for udvikling og vedligeholdelse af Python-baseret bioinformatisk workflow til design af qPCR-oligonukleotider rettet mod hele virusfamilier eller specifikke stammer. Denne aktivitet sikrer høj kvalitet i afdelingens analyser gennem systematisk dual-target design og kontinuerlig in silico kvalitetssikring af både nye og eksisterende assays, herunder assays, som anvendes rutinemæssigt i forbindelse med afdelingens funktion som referencelaboratorium. Workflowet muliggør udvikling og opdatering af pan-familie assays, som giver bredt dækkende diagnostik og øger sandsynligheden for hurtigt at identificere ukendte eller nye virusvarianter. Workflowet bidrager til det faglige beredskab på SSI, hvor hurtig identifikation eller udelukkelse af agens under et udbrud kan være afgørende for korrekt isolation, smitteforebyggelse og behandling. Arbejdet kombinerer bioinformatisk metodeudvikling med molekylærbiologisk forståelse for mikrobiologiske problemstillinger. Vores faglige sprog er engelsk og administrativt bruger vi dansk. Stillingen er en 2-årig tidsbegrænset stilling.

Dine primære arbejdsopgaver:

• vedligeholdelse og videreudvikling af specialiseret bioinformatisk workflow
• design af oligonukleotider til qPCR assays rettet mod højere taxonomiske niveauer af vira
• in silico kvalitetssikring af nye og eksisterende assays

Din baggrund

• Kandidatuddannelse eller højere indenfor (molekylær)biologi eller bioinformatik
• Erfaring med udvikling af Python-baserede workflows
• Erfaring med design af qPCR assays til detektion af virus i kliniske prøver og miljøprøver
• Erfaring med arbejdsgangen i højt automatiserede diagnostiske rutinelaboratorier
• Erfaring med bioinformatiske redskaber til analyse af udbrud

Vi tilbyder dig
Dine evner og dit engagement bidrager til at løse vores fælles kerneopgave.

SSI er en arbejdsplads, der er internationalt anerkendt for at løse nationale og globale sundhedsopgaver. Du bliver en del af en organisation med 900 medarbejdere, der løfter meningsfulde opgaver, som styrker menneskers og dyrs sundhed gennem forskning og beredskab.

Vores hverdag er præget af mange forskelligartede opgaver, åbne døre og et bredt samarbejde med engagerede og dygtige kollegaer. Du får mulighed for en fleksibel hverdag med en god balance mellem arbejde og fritid, da SSI er en arbejdsplads med en 37-timers arbejdsuge inkl. frokostpause, flekstidsaftale samt mulighed for hjemmearbejde og fleksibel arbejdstidstilrettelæggelse.

På SSI har vi en aktiv personale- og idrætsforening (IK-SERA) med holdtræning og motionslokaler, fredagsbar og forskellige sociale arrangementer – og vores Campus rummer endda både tennisbaner og egen børneinstitution. SSI er placeret centralt beliggende i København med grønne arealer og gode offentlige transportmuligheder (bus og metro) og har fri parkering på området.

Sådan er dit kommende team
Vores team udgøres af to bioanalytikere og tolv akademikere med varierende uddannelsesbaggrund og forskellige nationaliteter. Under sektionsledelsen arbejder vi sammen i en flad struktur, hvor alle er lige samarbejdspartnere. Vi har fokus på medarbejdertrivsel, faglig udvikling og internt samarbejde.

Lyder jobbet som noget for dig?
Send os dit CV og ansøgning. Vi beder dig om ikke at indsætte et foto i dit CV, da vi bestræber os for en mere inkluderende rekrutteringsproces med lige muligheder for alle vores jobansøgere.

Vi forventer at afholde samtaler fra uge 19

Har du yderligere spørgsmål til stillingen eller ansøgningsprocessen kan du kontakte mig, Mette Høgh, ANMG@ssi.dk, +4561518364. Du kan læse mere om, hvordan du ansøger og rekrutteringsforløbet på Job på SSI.

Dine ansættelsesvilkår
Du vil blive ansat i henhold til gældende overenskomst mellem Finansministeriet og Akademikernes Centralorganisation.

Vi ser frem til at høre fra dig.