Vil du arbejde med Linux, automatisering og bioinformatik i en national infrastruktur for personlig medicin? Er du nysgerrig på HPC og reproducerbare softwaremiljøer?

En organisation på vej mod noget nyt
Sundhedsdatastyrelsen bliver fra 2027 en del af Digital Sundhed Danmark sammen med sundhed.dk, MedCom og en række fælles nationale it-opgaver fra regionerne. Digital Sundhed Danmark bliver en landsdækkende organisation, der skal styrke den digitale udvikling og sikre bedre sammenhæng i sundhedsvæsenet.

Organisationen skal sikre fælles retning, bedre brug af sundhedsdata og udvikling af digitale løsninger, der understøtter borgere og sundhedsprofessionelle i hele landet. Etableringen betyder nye kollegaer, samarbejder og muligheder i et stærkt fagligt fællesskab.

Om Nationalt Genom Center
Du bliver en del af Nationalt Genom Center, som arbejder med national infrastruktur for personlig medicin og helgenomsekventering i Danmark. Vores tekniske platforme understøtter analyser af store mængder genomdata og anvendes i samarbejde med kliniske miljøer, forskere og nationale aktører. I teamet arbejder vi med drift og udvikling af bioinformatiske analyseværktøjer, softwaremoduler, HPC-miljøer, automatisering, dokumentation og support til brugere af NGC’s infrastruktur.

Din hverdag hos os
Som studentermedhjælper kommer du til at arbejde med praktiske og tekniske opgaver inden for bioinformatik, software deployment og HPC-drift. Du vil hjælpe os med at vedligeholde og udvikle softwaremiljøer, bioinformatiske værktøjer og tekniske workflows på NGC’s supercomputer. Opgaverne vil afhænge af dine kompetencer og interesser, og du vil få oplæring og tæt faglig sparring med erfarne bioinformatikere og HPC-specialister.

Dine primære arbejdsopgaver
I hverdagen kan du blandt andet komme til at udarbejde og teste EasyBuild-recipes til bioinformatiske værktøjer og pipelines, vedligeholde softwaremoduler i Lmod/Lua, teste og dokumentere programmer, workflows og kommandoer samt hjælpe med installation, opdatering og kvalitetssikring af værktøjer, der anvendes af klinikere, forskere og bioinformatikere. Du kan også komme til at afprøve og fejlsøge pipelines baseret på fx Nextflow, bash, Python eller containere, bidrage til teknisk dokumentation og interne runbooks samt deltage i mindre udviklings- og automatiseringsopgaver relateret til NGC’s bioinformatiske infrastruktur.

Du vil ikke stå alene med opgaverne. Vi forventer ikke, at du kan det hele fra starten, men vi forventer, at du har lyst til at lære og ikke er bange for en Linux-terminal.

Din uddannelse, erfaring og personlige kvalifikationer
Vi forestiller os, at du er i gang med en relevant videregående uddannelse, fx inden for bioinformatik, datalogi, softwareteknologi, bioteknologi, molekylærbiologi, sundhedsteknologi, data science eller lignende. Det er en fordel, hvis du har erfaring med Linux/Unix og kommandolinje, bash, Python, R eller lignende, bioinformatiske værktøjer eller filformater som FASTQ, BAM/CRAM eller VCF, Git og versionsstyring, HPC-miljøer, job schedulers, modul-systemer, containere som Singularity/Apptainer eller Docker, eller workflow-systemer som Nextflow eller Snakemake.

Det vigtigste er, at du er nysgerrig, systematisk og har lyst til at arbejde med tekniske detaljer i et miljø, hvor kvalitet, sporbarhed og stabilitet betyder noget.

Vi tilbyder
Du får et studiejob med stor faglig relevans og mulighed for at arbejde med teknologier, der bruges i moderne bioinformatik og personlig medicin. Du bliver en del af et miljø, hvor arbejdet har direkte betydning for, at forskere og kliniske miljøer kan anvende avancerede analyseværktøjer sikkert og effektivt. Vi tilbyder praktisk erfaring med national bioinformatisk infrastruktur, oplæring i EasyBuild, Lmod, HPC, software deployment og pipeline-drift, tæt sparring med specialister inden for bioinformatik, Linux, workflows og HPC samt fleksibilitet i forhold til studie og eksamensperioder.

Vi er placeret i historiske omgivelser sammen med Statens Serum Institut, 10 minutter på cykel fra Rådhuspladsen. Vi har rigelige gratis parkeringspladser.

Det sociale samvær vægtes højt i styrelsen, og vi har en aktiv personaleforening med en række klubber såsom løbeklub og vinklub. Der er endvidere fitnesscenter, gymnastiksal og tennisbane, som står til rådighed for styrelsens medarbejdere.

Vi er ikke lønførende, men vi værner om vores arbejdstid, og forventer generelt ikke, at du arbejder mere end aftalt i din kontrakt. Der er mulighed for at aftale hjemmearbejde, men vi vægter også tilstedeværelse med kolleger højt, fordi det giver bedre betingelser for faglig sparring, vidensdeling og samarbejde.

Kompetenceudvikling er et fokusområde, og du får mulighed for at styrke og udvikle dine kompetencer gennem interne og eksterne kurser.

Om ansættelsen
Løn og ansættelsesvilkår sker i henhold til Fællesoverenskomsten mellem Finansministeriet og Offentligt Ansattes organisation – Det Statslige Område og Cirkulære om organisationsaftalen for Kontorfunktionærer, laboranter, IT-medarbejdere (HK) i Staten jf. aftalens kapitel 6 vedrørende timelønnede.

Din ansættelse som studentermedarbejder er betinget af, at du er aktiv studerende og indskrevet ved en højere læreanstalt.

Gennemsnitlig ugentlig arbejdstid er på 10-15 timer om ugen med fleksibilitet i forhold til undervisning og eksamener

Du bliver omfattet af særlige vilkår. Det betyder blandt andet, at du skal kunne sikkerhedsgodkendes og kunne opretholde denne under hele ansættelsen. Du skal aflevere nødvendige oplysninger, herunder straffeattest, umiddelbart efter ansættelsesstart.

Vi har røgfri arbejdstid.

Kontakt os gerne
Få mere at vide om stillingen ved at ringe til bioinformatiker Nicolas Rapin på telefon 2483 2057.

Er du interesseret?
Klik på "søg stillingen" og send os din ansøgning med CV og eksamensbevis. Du må meget gerne skrive lidt om tekniske projekter, kurser, scripts, GitHub-repositories eller bioinformatiske opgaver, du har arbejdet med. Ansættelsessamtaler forventes afholdt i uge 25 og 26. Du kan læse mere om os på www.sundhedsdatastyrelsen.dk

Ansøgningsfristen er den 16. juni.

Sundhedsdatastyrelsen har røgfri arbejdstid og et røgfrit campus.

Vi opfordrer alle interesserede til at søge stillingen – uanset alder, køn, religion, handicap, etnisk baggrund.