Vil du være bindeleddet mellem udvikling og stabil drift inden for NGS-sekventering? Vi søger en akademiker, der vil spille en central rolle i udvikling, koordinering og kvalitetssikring af vores sekventeringsopgaver. Jobbets indhold Vi søger en akademiker, der kan understøtte udvikling, koordinering og stabil drift af afdelingens sekventeringsopgaver. Stillingen har fokus på sekventeringsrelaterede aktiviteter i tæt samarbejde med laboranter og bioinformatikere. Du vil arbejde med metodisk udvikling, tilpasning og videreudvikling af eksisterende NGS-baserede analyser samt implementering, validering og dokumentation af nye metoder til både forsknings- og rutinearbejdsgange. Derudover vil du også forventes at bidrage til kvalitetssikring, procesoverblik og løbende optimering af laboratorienære workflows samt koordinering i forbindelse med større opgaveflow og metodeoverførsel mellem udvikling og drift. Stillingen kræver fagligt overblik, struktur og evne til at skabe sammenhæng mellem udvikling og stabil drift i en tværfaglig organisation.
Du varetager opgaver, der understøtter afdelingens kerneopgaver samt metodeudvikling i tæt samspil med drift, herunder:
- Tager en central rolle i den faglige understøttelse af sekventeringsaktiviteter
- Indgå i tæt tværfagligt samarbejde med laboranter og bioinformatikere om planlægning, prioritering og implementering af metoder
- Drive metodisk udvikling samt tilpasning og videreudvikling af NGS-baserede analyser med fokus på robusthed og stabil drift og sikre smidig metodeoverførsel fra udvikling til drift
- Ansvar for implementering, validering og dokumentation af nye metoder til både forskningsprojekter og rutinearbejdsgange
- Bidrage aktivt til kvalitetssikring, overblik over processer og løbende optimering af workflows
- Koordinere større projekter i forbindelse med afdelingens sekventeringsopgaver
Din baggrund Du har en relevant akademisk uddannelse fx biologi, bioteknologi, biokemi el.lign. Dertil har du omfattende laboratorieerfaring og indgående kendskab til NGS-baserede sekventeringsmetoder, herunder WGS-, amplikon-, og metagenomisekventering, samt RNA-Seq.
Generelle krav:
- Betydelig erfaring med forskellige sekventeringsplatforme, herunder Illumina og Nanopore
- Forståelse for arbejdsgange i en sekventeringsenhed med høj driftsforpligtelse, hvilket inkluderer automatisering på pipetteringsrobotter, (f.eks Hamilton, Biomek, Tecan og Opentron)
- Erfaring med microbiom-relatede studier og analysemetoder
- Publikationserfaring
- Du behersker engelsk i tale og skrift på højt niveau
Derudover er det en fordel, hvis du har:
- Erfaring fra forsknings- eller udviklingsarbejde, gerne på PhD-niveau
- Erfaring med koordinering eller faglig understøttelse af laboratorieteams
Vi tilbyder en stilling i et stærkt fagligt miljø med fokus på samfundskritiske opgaver inden for overvågning og diagnostik. Arbejdet foregår i tæt samarbejde med erfarne kolleger og understøtter centrale funktioner på SSI.
Vi tilbyder Vi tilbyder en stilling med et alsidigt og udviklende indhold. Vi lægger vægt på et spændende fagligt miljø i samarbejde med dygtige og engagerede kolleger. I forbindelse med diverse opgaver er der potentiale for et udfordrende og spændende samarbejder på tværs af faggrænser. Der vil være rig mulighed for selvstændigt at udvikle jobindholdet afhængigt af individuelle forudsætninger og ønsker. Vi har fleksible arbejdstider og gode muligheder for efteruddannelse.
Om Afdelingen for Sekventering og Bioinformatik Afdelingen for Sekventering og Bioinformatik på SSI er en del af det nationale diagnostiske infektionsberedskab og varetager opgaver indenfor sekventering og bioinformatiske analyser af en lang række sygdomsfremkaldende mikroorganismer. Afdelingen består af ca. 30 medarbejdere der inkluderer både laboranter, molekylærbiologer, bioinformatikere og systemadministratorer. Heriblandt er en gruppe udviklingsfokuserede akademikere, der varetager udviklingsopgaver, validering og automatisering af nye NGS-baserede metoder. Du vil blive en del af denne innovationsgruppe, der består af 2 akademikere udover dig, og du vil arbejde tæt sammen med både sekventeringsenheden og afdelingens bioinformatikere.
Om ansættelsen Du bliver ansat efter gældende overenskomst mellem Finansministeriet og Akademikernes Centralorganisation.
Ansættelsen er tidsbegrænset til 1 års varighed.
Kontakt os gerne Du er velkommen til at kontakte Afdelingschef Marc Stegger på tlf.: 3268 8141 eller mtg@ssi.dk for yderligere information.
Er du interesseret? Klik på ”søg stillingen” og send os din ansøgning med CV og eksamensbevis. Ansættelsessamtaler forventes afholdt fra uge 5.
